Родился в Роттердаме (Нидерланды) в 1949 году. Хореографическое образование получил в Академии танца Роттердама. Затем в течение 15 лет являлся одним из ведущих солистов Nederlands Dans Theater — Нидерландского театра танца. Здесь же в 1974 году он впервые попробовал свои силы в качестве хореографа. Не заставили себя долго ждать и последующие хореографические эксперименты Кристе, в том числе постановка «Quartet 1», с которой он выиграл первый приз на знаменитом конкурсе хореографии в Кельне в 1979 году. С 1986 по 1992 год Кристе руководил Scapino Ballet (Нидерланды).
За последние 20 лет Нильс Кристе много работал в Нидерландах, в том числе ставил балеты для Dutch National Ballet — Национального балета Нидерландов. В общей сложности он сотрудничал с 68 компаниями в 25 странах мира. Начиная с 1981 года, у Кристе сложилась тесная творческая связь с компанией Introdans. К настоящему времени труппой Introdans представлено публике уже более 20 его произведений.
Его творческим катализатором, по признанию самого хореографа, всегда была и остается музыка. Критики из разных стран единодушно присвоили ему звание — настоящий «музыкальный хореограф». По сложившейся традиции еще перед первой встречей с артистами в репетиционном зале, Кристе подвергает скрупулёзному анализу каждый выбранный для новой постановки музыкальный фрагмент. В своих рабочих тетрадях он словно препарирует музыкальные фразы, разбивая их на составные части, и вновь синтезирует единое целое, чтобы понять механизм возникновения эмоций.
Результат этого труда виден каждому. Хореография Кристе пронизана смыслом, каждый жест направлен на достижение абсолютно осязаемой зрителем цели. Его хореографический текст становится продолжением текста музыкального, — естественным расширением мира, созданного композитором.